Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf135Q5VTT2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C9orf135Q5VTT2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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