Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
STRIP1Q5VSL9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms