Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms