Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms