Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALFQ53S48 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms