Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYTL3Q4VX76 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms