Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms