Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TWISTNBQ3B726 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms