Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LETM2Q2VYF4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LETM2Q2VYF4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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