Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL40Q2TBA0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms