Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RTN1Q16799 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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RTN1Q16799 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RTN1Q16799 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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