Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms