Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms