Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ACKR1Q16570 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms