Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK5Q16478 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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