Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDCD2Q16342 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD2Q16342 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms