Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZIC1Q15915 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZIC1Q15915 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms