Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
VAMP3Q15836 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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VAMP3Q15836 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VAMP3Q15836 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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