Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBE3CQ15386 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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UBE3CQ15386 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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UBE3CQ15386 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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UBE3CQ15386 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE3CQ15386 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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