Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
EBI3Q14213 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms