Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RASGRF1Q13972 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms