Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms