Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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