Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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