Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM2Q13029 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
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