Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms