Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CDH17Q12864 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDH17Q12864 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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