Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFIAQ12857 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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