Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFFO1Q0D2I5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms