Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms