Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDE4DQ08499 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms