Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms