Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPN12Q05209 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms