Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX1P78337 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms