Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TUBA4AP68366 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TUBA4AP68366 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TUBA4AP68366 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TUBA4AP68366 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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