Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
UBE2NP61088 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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