Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLK1P49759 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLK1P49759 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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