Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN1P49257 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms