Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPARGP37231 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms