Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM23P36406 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms