Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJC1P36383 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms