Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GJA4P35212 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GJA4P35212 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJA4P35212 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms