Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXA7P31268 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms