Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HOXA6P31267 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HOXA6P31267 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXA6P31267 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXA6P31267 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms