Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SERPINB3P29508 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SERPINB3P29508 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.2 ms