Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR2AP24928 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms