Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPREP23469 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPREP23469 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPREP23469 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms