Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP4AP20648 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP4AP20648 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms