Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms