Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GM2AP17900 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GM2AP17900 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GM2AP17900 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GM2AP17900 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GM2AP17900 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms